日本精子库目前有4种取精方式，分别是自慰法、电动按摩法(使用取精器)、避孕套和手术取精，其中自慰法是最常用的，患者在特定的取精房间内，通过视听刺激感官自行手淫取精。如果这种方法无法顺利取精，就可以考虑使用电动按摩法或特制避孕套进行取精。而最后一种手术取精主要适用于那些自精保存，保存生育能力的患者。
根据捐精者叙述，目前日本精子库取精方式主要是手淫取精，如果不行可以使用取精器进行按摩取精，如果还不行可以找护士要特制的避孕套拿回家同房取精，射精后需要在半个小时内赶回医院，否则射出的精子存活率会明显降低。最后一种方法是手术取精，适用于本身就有不育疾病但是需要自精保存的男性。
日本独协医科大学在2021年6月份在崎玉县设立日本首家精子库，并且现在正在招募捐献者，捐献者范围限制在20岁至40岁的医务工作者中，之所以这样做是因为医务工作者具备相关专业知识，有助更好地开展人工受精服务。目前日本精子库取精主要有4种方式：
1、手淫法
多数志愿者都是使用该方法取精，提前用肥皂洗手和外生殖器，手淫后将精液排入专门准备的无菌杯中。在实际取精过程中一定要注意相关的清洁工作，否则可能会被手上的细菌涌入生殖器而困扰。
2、电动按摩法
手淫取精困难的捐献者可以通过电按摩的方式取精，将生殖器放入特制的电按摩装置，然后通过按摩前列腺刺激精液排出，这种方法比较麻烦，但是取精效果好。
3、避孕套
普通的避孕套中含有杀精剂会对精液质量造成影响，所以这里取精用的避孕套必须是特制的，男性戴套进行同房，排出精液后即抽出阴茎，从避孕套中即可获得精液，之后必须要及时到医院里面去才能够避免时间过长影响到精子的活性。
4、手术取精
有三种方法分别是经皮附睾穿刺取精术，适用于不可逆梗阻性无精子症患者;睾丸穿刺取精术适用于非梗阻性无精子症以及梗阻性无精子症患者附睾内未找到可利用的精子;睾丸显微取精术适用于非梗阻性无精子症病人。
